NTRK1/2/3基因編碼TRKA/B/C蛋白,在神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育中起重要作用。NTRK基因融合變異導(dǎo)致TRK融合蛋白產(chǎn)生將會(huì)激活MAPK和PI3K信號(hào)通路并驅(qū)使腫瘤增殖、存活、侵襲和血管生成。
第一個(gè)TRK融合蛋白于1982年在結(jié)直腸腺癌細(xì)胞系中被發(fā)現(xiàn)。隨后,在其他多種腫瘤類型中也相繼發(fā)現(xiàn)了NTRK1-3基因融合,這一發(fā)現(xiàn)燃起了藥企開發(fā)泛瘤種TRK蛋白抑制劑的熱情。其中,最為出名的當(dāng)屬拉羅替尼(拜耳)和恩曲替尼(羅氏),分別于2018年11月和2019年8月獲FDA批準(zhǔn)上市,并于2022年4月和2022年7月獲NMPA附條件批準(zhǔn)上市,讓跨瘤種的精準(zhǔn)治療成為現(xiàn)實(shí)。
這種藥物獲批上市的一個(gè)重大進(jìn)步是出現(xiàn)了“pan-tumor”(泛瘤種)或“tumor-agnostic”(腫瘤不可知)療法,只要NTRK基因融合便可接受TRK抑制劑的靶向治療,而不管腫瘤的物理起源部位如何。同時(shí),醫(yī)療衛(wèi)生系統(tǒng)在整合這些治療方面面臨著重大挑戰(zhàn),主要是因?yàn)椴淮_定的患病率和確定合格患者的最佳檢測(cè)方法。
2023年3月13日,《Nature》子刊《Scientific Reports》發(fā)表了迄今為止最全面的泛瘤種NTRK1/2/3基因融合患病率系統(tǒng)綜述,以期為公共醫(yī)療衛(wèi)生系統(tǒng)挑戰(zhàn)提供信息,即如何篩選實(shí)體瘤人群的NTRK基因融合,并預(yù)測(cè)可能符合TRK抑制劑治療條件的患者比例。同時(shí),該研究支持對(duì)晚期癌癥患者進(jìn)行廣泛的NGS檢測(cè),理想情況下是DNA+RNA組合檢測(cè)!
該研究團(tuán)隊(duì)共納入160項(xiàng)研究(2011-2021),對(duì)15種泛癌和429種特定癌癥類型(63種兒童癌癥)進(jìn)行了系統(tǒng)評(píng)價(jià),同時(shí)在PROSPERO進(jìn)行注冊(cè),并遵循系統(tǒng)評(píng)價(jià)和Meta薈萃分析優(yōu)先條目(PRISMA)。
研究概況
經(jīng)過文獻(xiàn)篩選后共有160項(xiàng)研究被納入系統(tǒng)評(píng)價(jià)。NTRK基因融合研究大多數(shù)從2019年(62%)開始發(fā)表,31%的研究(n=51)來自美國(guó),其次是中國(guó)和國(guó)際研究(均為14%),并且69%(n=114)的研究至少進(jìn)行了一次DNA和/或RNA分析。
研究團(tuán)隊(duì)對(duì)15種泛癌和429種特定癌癥類型(63種兒童癌癥)進(jìn)行了系統(tǒng)評(píng)價(jià)。其中,肺癌、兒童癌癥、結(jié)直腸癌和甲狀腺癌是分析最多的癌癥類型,分別有36、24、19 和19項(xiàng)研究,占所有納入研究的61%。
研究結(jié)果
(1)泛瘤種中,成人或混合年齡組的NTRK基因融合患病率都低于1%,范圍為0.03%~0.7%;兒童組的NTRK基因融合患病率相較成人來說比例更高,范圍為0.44%~3.33%。使用RNA-NGS或WGS檢測(cè)方法的NTRK基因融合檢出率更高,使用DNA-NGS、ctDNA或IHC檢測(cè)方法的檢出率相對(duì)來說較低。
(2)NTRK1、NTRK2和NTRK3基因融合的相對(duì)比例在泛瘤種中有所不同,但NTRK3基因融合通常是最常見的。NTRK2基因融合率低可能是由于與NTRK1相比,難以識(shí)別NTRK2的融合斷點(diǎn),特別是使用DNA-NGS panel檢測(cè)。
(3)結(jié)直腸癌、非小細(xì)胞肺癌、黑色素瘤、乳腺癌、前列腺癌和胰腺癌等主要癌癥類型的NTRK基因融合發(fā)生率較低,范圍在0.10~0.25%之間,證實(shí)了廣泛未選擇癌癥人群中NTRK基因融合的罕見性。甲狀腺癌和肉瘤的發(fā)病率更高,但仍然很少見,約為1%。在驅(qū)動(dòng)基因陰性肺癌和MSI-H/dMMR結(jié)直腸癌中,NTRK基因融合更常見,并且在兩種癌癥靶向治療耐藥后的患者中發(fā)生率也相對(duì)較高。綜合而言,盡管NTRK基因融合很罕見,但證據(jù)支持廣泛的癌癥類型可能以非常低的頻率存在NTRK基因融合,臨床應(yīng)予以重視。
(4)該研究團(tuán)隊(duì)對(duì)綜合分析的結(jié)果進(jìn)行了進(jìn)一步的驗(yàn)證,對(duì)常見癌癥類型的NTRK基因融合發(fā)生率與先前的薈萃分析和Foundation Medicine隊(duì)列進(jìn)行了對(duì)比分析,證明了這些廣泛癌癥群體NTRK基因融合的一致性。
(5)從患者角度來看,NGS檢測(cè)是首選,最好是在新鮮組織樣本上進(jìn)行;如果NGS檢測(cè)可及性不夠,NTRK FISH或pan-TRK IHC可作為診斷使用,前提是有足夠的組織樣本可使用,適用于所有的實(shí)體腫瘤。
(6)支持對(duì)晚期癌癥患者進(jìn)行廣泛的NGS檢測(cè)(理想情況下是DNA+RNA的組合平臺(tái)檢測(cè)),該檢測(cè)具有更大的檢測(cè)范圍具備檢測(cè)NTRK基因融合類型的能力,而且還具有檢測(cè)其他可靶向和潛在罕見融合和突變的能力。
綜合而言,這篇綜述提供了迄今為止文獻(xiàn)中關(guān)于實(shí)體瘤中NTRK基因融合流行的全面證據(jù)。盡管罕見,但NTRK基因融合的癌癥類型范圍廣泛,詳細(xì)和準(zhǔn)確的流行病學(xué)數(shù)據(jù)對(duì)于支持有效識(shí)別和治療這些罕見但可靶向的泛瘤種生物標(biāo)志物患者的衛(wèi)生服務(wù)至關(guān)重要。
全國(guó)共有49家實(shí)驗(yàn)室報(bào)名參加,其中45家提交有效結(jié)果,僅23家通過評(píng)價(jià)活動(dòng),通過率為51.1%。
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